阿米巴經營的費用負擔處理得非常嚴，絕不允許發生“糊涂賬、籠統賬”和把多種費用合在一起計算的情況。
——稻盛和夫
在單位時間效益核算中，最重要的是構成阿米巴的全體人員對自己的阿米巴的情況隨時隨地都能了如指掌。因此，每天的會計處理必須“正確、明確、迅速”。發生的事，立即作為阿米巴的收益或費用來認識，這同時也是實踐“一一對應”原則。
生產實績、出貨實績，阿米巴每天要掌握每一項內容以及實績總額，這是理所當然的。同時由第二天早上的銷售額生產日報來驗證。還有資材費用和其他所支付的費用，各阿米巴也要隨時掌握，并由第二天早上配發的費用日報等計算機資料來驗證。
這樣做的結果，各個阿米巴不僅可以在宏觀上把握整體的情況，即由數字歸納的經營實況；同時又可以在微觀上理解構成數字的每一項具體細節。
另外，在阿米巴經營中，各阿米巴可以在自己職責范圍內管理所有的收益和費用。例如某阿米巴賣掉貴金屬屑，當然要作為該阿米巴的收益處理。會計上賣掉機械設備的收入作為特別收益通常不包括在經常收益之內，但是這部分收益也計入處理該設備的阿米巴的收益之內。同樣，報廢或處理機械設備所產生的特別損失也有相應的阿米巴來承擔。所有的收益、費用都在某個確定的部門的職責范圍內發生，所以構筑管理體系時就要明確有關事情發生時該由哪個部門管轄。
從這個意義上說，不能有下述情況發生：發生的費用由哪個阿米巴承擔不清楚；突然有來歷不明的費用要求某阿米巴支付。因為這違反了“阿米巴自己負責、自主經營”的阿米巴經營原則。為此，財務人員不可僅從“會計的判斷”角度隨意決定負擔費用的部門和會計科目，管理體系要讓阿米巴責任人能按規則由自己判斷如何管理費用。
這樣，在阿米巴經營中，基本上各阿米巴可以直接管理、自行負責的費用都反映到了阿米巴的核算上。比如工場等支撐阿米巴經營時必然發生的間接費。具體說，直接向阿米巴提供服務的工場和事務所的總務、人事、資材、財務等間接部門的費用，作為“公共費用”，以阿米巴可以接受的方法分擔。這樣做的結果，間接部門的人員就知道自己要靠阿米巴的收益來支持，因此必須努力節約經費、更有效地為阿米巴提供服務。
另一方面，總公司的總務、人事、資材、財務等管理部門的費用不讓阿米巴分攤。總公司管理部門通過其業務管轄下的工場、事業所的間接部門向各阿米巴提供服務。但與工場、事業所的阿米巴日常并不接觸。因為總公司不對阿米巴產生直接影響，所以其費用不讓阿米巴分擔。一般在把事業部門作為獨立核算單位做損益表時，大多是把總公司的費用作為“一般管理費”讓事業部負擔。但在單位時間核算制度中，為了充分尊重阿米巴作為經營主體的地位，就不按一般會計常識做，與阿米巴沒有直接關系的總公司費用不讓阿米巴負擔。
并且，總公司管理部門實際發生的費用，在每月召開的公司全體會議上，由各部門與其預算相對比，做出報告，各個部門嚴加管理。這些費用計入總公司部門這一科目之內。現在京瓷的總公司管理部門的經費以及全公司的戰略費用等都由總公司部門的收入，即資金運用收益來提供。
如上所述，阿米巴經營的費用負擔處理得非常嚴，絕不允許發生“糊涂賬、籠統賬”和把多種費用合在一起計算的情況。
實際上，在京瓷內部各個部門，每天的所有費用都被嚴格確認，不管數目多小，自己部門不該負擔的費用，用“經費移動”的方式轉記到實際應該負擔或分擔的部門。這種“經費移動”不僅在同一工場內而且在全公司內進行，因而事務處理的工作量會增加。但是，只有公正公平地處理所有的事務，才能維持阿米巴的道德和活力。從這個意義上講，這樣的處理工作是不可缺少的。
一般認為“管理會計”做出的報告，和“財務會計”做出的報告——對外的結算報告——性質不同，相互獨立。然而，既然兩者都是為了正確認識企業經營的實態，兩者的報告內容必須具有整合性。事實上，在京瓷，作為“管理會計”的“單位時間效益核算”與對外公布的“結算表”保持了明確的整合性。因此，各阿米巴對自己的業績與公司整體業績的直接關聯性認識得很清楚。每年年初，社長發表的“經營方針”中，都會把作為“結算基礎”的公司整體業績目標同各事業部作為“單位時間效益核算基礎”的業績目標緊密地連在一起。
